Postdoktor (stipendium) inom bioinformatik, Umeå universitet
Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi
Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Är du intresserad av att veta mer om vad det innebär att vara stipendiat läs mer här
Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.
Forskargruppen Dwibedi vid Institutionen för klinisk mikrobiologi och Laboratoriet för molekylär infektionsmedicin Sverige (MIMS; https://www.mims.umu.se/), Umeå universitet, söker en postdoktor (2 år) inom bioinformatik. Projektet syftar till att undersöka mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner i tidig ålder.
Forskningsområde
Forskargruppen strävar efter att kartlägga mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner inom longitudinella dataset från människans tarmmikrobiota.
Din roll
Du kommer att bedriva forskning i Chinmay Dwibedis laboratorium (www.dwibedilab.org) i nära samarbete med lokala och internationella experter. Du kommer särskilt att använda bioinformatiska och statistiska metoder för att analysera data från människans tarmmikrobiom i stora kohorter.
Ansvarsområden
- Analys av mikroorganism-mikroorganism och värd-mikroorganism-interaktioner i flera kohorter (n = 2000)
- Utvärdera skillnader i fitness hos specifika stammar i olika populationer
- Studera struktur och funktion hos mikrobiella gener över olika stammar
- Delta i och bidra till vetenskapliga gruppmöten
- Koordinera uppgifter med samarbetspartners
- Bidra till publicering av forskningsresultat
- Delta i utbildning och handledning av forskare och forskarstuderande
- Följa universitetets policyer för lika möjligheter och dataskydd
Urvalskriterier
Obligatoriska krav:
- Doktorsexamen i beräkningsbiologi, bioinformatik eller datavetenskap med fokus på tarmmikrobiomdata
- Utmärkta skriftliga och muntliga kunskaper i engelska
- Betydande erfarenhet av att hantera stora metagenom-dataset (försteförfattarpublicering krävs)
- Relevant erfarenhet av programmering i R och/eller Python (t.ex. utveckling av pipelines för metagenomanalys, skapande av metagenomassemblies)
- Förmåga att arbeta både självständigt och i team
- Förmåga att leverera resultat enligt krav och tidsplan
- Förmåga att organisera och prioritera egna uppgifter med minimal handledning
Forskningsmiljö
Dwibedi-labbet är en del av SciLifeLab och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (DDLS; https://www.scilifelab.se/data-driven/), ett 12-årigt initiativ för att rekrytera och utbilda nästa generation datadrivna livsvetare.
Du kommer att vara knuten till Institutionen för klinisk mikrobiologi vid Umeå universitet (https://www.umu.se/en/department-of-clinical-microbiology/) samt till det nationella DDLS-programmet, vilket ger tillgång till beräkningsresurser, forskarskola och andra utbildnings- och nätverksmöjligheter i Sverige.
Du kommer även att vara knuten till MIMS (https://www.mims.umu.se/), som är medlem i Nordic EMBL Partnership for Molecular Medicine. Det finns möjligheter till samarbete med experter i Europa och globalt. Lokalt är forskargruppen även knuten till Umeå centrum för mikrobiell forskning (UCMR; https://www.umu.se/ucmr/om-ucmr/), ett tvärvetenskapligt forskningscentrum med fokus på mikrobiell patogenes.
Sammanfattning av stipendiet
- Heltid, 2-årigt stipendium (skattefritt)
- Start: sommaren 2026
Kontaktperson
Chinmay Dwibedi
Institutionen för klinisk mikrobiologi
E-post: chinmay.dwibedi@umu.se
Ansökan
Ansökan ska innehålla:
1. Personligt brev med motivering och kvalifikationer
2. CV inklusive publikationslista
3. Kopia av doktorsexamensbevis och andra relevanta examensbevis
4. Kontaktuppgifter till två referenser
| Tillträde | Tidigt 2026 |
|---|---|
| Löneform | Stipendium |
| Sysselsättningsgrad | 100 |
| Ort | Umeå |
| Län | Västerbottens län |
| Land | Sverige |
| Referensnummer | FS 2.1.6-2138-25 |
| Kontakt |
|
| Publicerat | 2025-12-02 |
| Sista ansökningsdag | 2026-03-01 |